武汉大学人民医院与中科院武汉病毒研究所持续开展相关观察研究。发现部分新型冠状病毒感染的肺炎患者首发症状仅为腹泻，怀疑消化系统也可能传播新型冠状病毒。后来，中科院武汉病毒研究所石正丽研究员实验室从这些患者的大便和肛拭子中发现病毒核酸。研究团队据此提出，在前期国家权威指南提出飞沫传播、接触传播的基础上，新型冠状病毒还存在一定的粪口传播。临床医师特别是消化内科医师应高度关注新型冠状病毒感染的肺炎不典型症状，针对患者呕吐物、粪便等做好个人防护。研究团队提醒，轻症患者居家隔离时，应格外重视手卫生，同时尽可能避免与家庭成员共用卫生间。如无单独卫生间，每次使用后，可通过乙醚、75%乙醇、含氯消毒剂、过氧乙酸和氯仿等脂溶剂，做好居家隔离消毒。

2月1日，深圳卫健委发布消息，研究者在新冠肺炎患者粪便中检测出2019-nCoV核酸阳性，很有可能提示粪便中有活病毒存在。冠状病毒研究专家称，从SARS经验看，若有活病毒存在，表示粪便具有传染性。他建议，冲水时要盖好马桶盖，避免粪便中的病毒传播。